曲阜师范大学计算机学院现设有计算机科学与技术、通信与信息系统2个学术型硕士学位专业，计算机技术1个专业型硕士学位专业,每年招收全日制硕士生40余人。

（一级学科、学术学位）计算机科学与技术（专业代码：077500）

 主要研究方向：

 1、计算机网络与通信

 2、并行与分布式计算

 3、无线网络与通信

 4、信息安全、嵌入式系统

 5、智能信息处理

 6、图像分析与处理

 7、服务计算

 8、数据挖掘等

（二级学科、学术学位）通信与信息系统（专业代码：081001）

 主要研究方向：

 1、信息处理与信息安全

 2、移动通信等

（专业学位）计算机技术（专业代码085211）

 主要研究方向：

 1、计算机网络与应用

 2、网络数据库

 3、嵌入式系统

 4、信息安全技术

 5、物联网应用技术

 6、图像处理技术等